| Studiju veids |
bakalaura akadēmiskās studijas |
| Studiju programmas nosaukums |
Viedās datortehnoloģijas |
| Nosaukums |
Reakciju atpakaļievietošanas metodes izstrāde optEnvelope programmai |
| Nosaukums angļu valodā |
Method for Reaction Reinsertions for optEnvelope Program |
| Struktūrvienība |
33000 Datorzinātnes, informācijas tehnoloģijas un enerģētikas fakultāte |
| Darba vadītājs |
Kristaps Bērziņš |
| Recenzents |
Dmitrijs Bļizņuks |
| Anotācija |
Bakalaura darbā risināta reakciju atpakaļievietošanas problēma, kas ir aktuāla sarežģītu metabolo tīklu modelēšanā. Šādos modeļos reakcijas bieži tiek izslēgtas, lai samazinātu to sarežģītību vai identificētu minimālās dzīvotspējas struktūras. Tomēr praksē rodas nepieciešamība šīs reakcijas atjaunot, lai saglabātu sistēmas darbību vai uzlabotu tās efektivitāti. Darba mērķis bija izstrādāt jaunu reakciju atjaunošanas algoritmu, ko iespējams integrēt optEnvelope un COBRA Toolbox rīkā, izmantojot MATLAB vidi. Izstrādātais algoritms balstīts uz iteratīvu reakciju ievietošanu, vadoties pēc mērķfunkcijas sasniegšanas, kas ļauj precīzāk noteikt būtiskākās reakcijas. Darbā veikta esošo reakciju ievietošanas metožu analīze un optEnvelope struktūras izpēte, lai nodrošinātu saderību ar izstrādāto risinājumu. Algoritms testēts uz ecoli_core_model, salīdzinot to ar esošo pieeju, un iegūtie rezultāti parāda uzlabojumus biomases un produkta attiecībā, saglabājot sistēmas stabilitāti. Darbs veido stabilu pamatu tālākai metodes attīstībai un pielietošanai biotehnoloģijas un optimizācijas uzdevumos. |
| Atslēgas vārdi |
optimizācija, COBRA Toolbox, optEnvelope, MATLAB |
| Atslēgas vārdi angļu valodā |
optimization, COBRA Toolbox, optEnvelope, MATLAB |
| Valoda |
lv |
| Gads |
2025 |
| Darba augšupielādes datums un laiks |
28.05.2025 00:07:26 |
